PETRITIS K. et al. Analytical Chemistry, 2003. v.75, issue 5, p.1039-1048. RU 2285253 C1, 10.10.2006. RU 2156468 C2, 20.09.2000. HIRSCHBERG D.S. Journal of the ACM, 1977, v.24, p.664-675.
Имя заявителя:
Российская Федерация, от имени которой выступает Министерство образования и науки Российской Федерации (Минобрнауки России) (RU), Учреждение Российской академии наук Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля РАН (ИБХФ РАН) (RU)
Изобретатели:
Автономов Дмитрий Михайлович (RU) Кононихин Алексей Сергеевич (RU) Попов Игорь Алексеевич (RU) Николаев Евгений Николаевич (RU) Ларина Ирина Михайловна (RU) Пастушкова Людмила Ханифовна (RU)
Патентообладатели:
Российская Федерация, от имени которой выступает Министерство образования и науки Российской Федерации (Минобрнауки России) (RU) Учреждение Российской академии наук Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля РАН (ИБХФ РАН) (RU)
Реферат
Изобретение относится к анализу биологических материалов и, в частности, сложных биологических смесей. Способ включает отбор образца от биологического объекта, подлежащего исследованию, получение пептидной смеси, готовой для хромато-масс-спектрометрии, проведение хромато-масс-спектрометрии, сравнение полученной хроматограммы с эталонной и нахождение наиболее общих подпоследовательностей, при этом нахождение наиболее общих подпоследовательностей осуществляют следующим образом: проводят построение матрицы, по горизонтали которой откладываются массы из одной хроматограммы, отсортированные по времени элюирования, по вертикали - массы из второй хроматограммы, отсортированные тем же образом, на пересечении строки и столбца ставится значение функции точности совпадения масс для задания порога отсечения пиков, не совпадающих по массе, далее начинают обход матрицы, начиная с правого нижнего угла, на каждом шаге разрешается смещаться на одну клетку влево, вверх или по диагонали, двигаясь в направлении наименьшего изменения значений в ячейках матрицы, если все окружающие значения одинаковы, то делается шаг по диагонали, а в случае, когда при этом значения в текущей ячейке, в той, куда сделан шаг, различаются, соответствующие массы добавляются к наибольшей общей подпоследовательности, если достигнута крайняя левая либо верхняя граница матрицы, шаги продолжаются в оставшемся допустимом направлении, после окончания обхода получившуюся последовательность необходимо записать в обратном порядке, начиная с конца. Достигается повышение надежности выравнивания. 1 пр., 2 табл., 2 ил.
Поиск патентов
Получить полное описание патента