СПОСОБ ПОВЫШЕНИЯ ТОЧНОСТИ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ АМИНОКИСЛОТНЫХ ОСТАТКОВ БИОПОЛИМЕРА НА ОСНОВЕ ДАННЫХ МАСС - СПЕКТРОМЕТРИЧЕСКОГО АНАЛИЗА, ВЫЧИСЛИТЕЛЬНАЯ СИСТЕМА
ALVES G. et al. RAId-DbS: mass-spectrometry based peptide identification web server with knowledge integration. BMC Genomics. 2008, 9:505, найдено в PubMed: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2605478/pdf/1471-2164-9-505.pdf. US 2006188887 A1, 24.08.2006. WO 2008151140 A2, 11.12.2008. WO 2007112289 A2, 04.10.2007. EDWARDS N.J. Novel peptideidentification from tandem mass spectra using ESTs and sequence database compression. Molecular Systems Biology, 2007, 3, N102, найдено в PubMed: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC 1865584/pdf/msb4100142.pdf.
Имя заявителя:
Общество с ограниченной ответственностью "Интерлаб" (RU)
Изобретатели:
Арчаков Александр Иванович (RU) Згода Виктор Гаврилович (RU) Лисица Андрей Валерьевич (RU) Мошковский Сергей Александрович (RU) Чернобровкин Алексей Леонидович (RU)
Патентообладатели:
Общество с ограниченной ответственностью "Интерлаб" (RU)
Реферат
Изобретение относится к биоинформационным методам идентификации белков и пептидов по геномным базам данных. Способ заключается в том, что алгоритмы сопоставления масс-спектров с геномной базой данных применяются повторно после дополнения базы данных новыми записями, либо после удаления из базы данных записей, либо после замены базы данных базой данных, составленной из новых записей. Дополнительные записи генерируются путем внесения в последовательности идентифицированных биополимеров изменений, соответствующих заменам, делециям, вставкам и модификациям одного или нескольких аминокислотных остатков. Настоящее изобретение также относится к вычислительной системе, функционирование которой основано на раскрытом выше способе. Использование изобретения позволяет повысить точность идентификации последовательности аминокислотных остатков биополимера. 2 н. и 3 з.п. ф-лы, 1 ил.
Поиск патентов
Получить полное описание патента